Компаниянын келип чыгышы 1995-жылга барып такалат. «Кыргызнефтегаз» ачык акционердик коому менен «ПетроКыргызстан» (Джерси) жоопкерчилиги чектелген коомунун ортосунда «Кыргыз Петролеум Компани» ЖАК биргелешкен ишканасын түзүү боюнча келишим түзүлдү. Бул бүтүмдүн катышуучуларынын ортосунда үлүштөр 50/50 бөлүштүрүлгөн. 1995-жылдын декабрында Кыргыз Республикасынын Өкмөтү менен Инвестициялык макулдашууга кол коюлгандан кийин чет өлкөлүк инвестор Инвестициялык макулдашуу боюнча милдеттенмелерди каржылоо үчүн инвестициялык каражаттарды, анын ичинде мунай иштетүүчү заводду (ЖК) курууга жана өнүктүрүүгө алгачкы салымды берген. Жалал-Абад шаарында нефтини кайра иштетүүчү заводдун курулушу 1996-жылдын январында башталып, өз мөөнөтүндө – 1996-жылдын сентябрь айында бүткөрүлгөн. “КПК” ЖАК нефтини кайра иштетүүчү заводу 1996-жылдын 6-октябрында салтанаттуу түрдө ачылган.

1996-жылдын июнь айында компания Кыргыз Республикасында бул иш үчүн зарыл болгон атайын жабдууларды колдонуу менен кендерди иштетүүнү баштаган. Кендерди алдын-ала техникалык баалоо мунайлуу катмарларды гидравликалык жардыруу мунай алууну жакшыртуунун эң эффективдүү  жана рентабелдүү ыкмасы экендигин көрсөттү. 21 мунай скважинасын камтыган сыноо программасы 1996-жылдын октябрында башталган. 1996-жылдын соңунда  инвестор компаниянын документтеринде милдеттенме катары каралган каражаттарды толугу менен аткарып, мунайды кайра иштетүүчү заводдорду жана кендерди иштетүүгө инвестициялоону уланткан. Ошол эле учурда заводду жаңы шарттарга ылайыкташтыруу үчүн кошумча цистерналар жана жүктөөчү жабдуулар орнотулган. 1998-2001-жылдары өндүрүлгөн бензиндин октандык көрсөткүчүн жогорулатуу үчүн заводдо жаңы техникалык өркүндөтүүлөр жүргүзүлгөн. Буга Кыргызстанга алынып келинген чет элдик заманбап автоунаалардын көбөйүшү себеп болгон.

2012-жылы Компания өзүнүн скважиналарынан мунай өндүрүү ишин токтотуп, мунай жана чийки заттын башка түрлөрүн кайра иштетүүгө басым жасаган. 2012-жылдын 6-ноябры компания үчүн тарыхый дата болгон. Бул күнү «Кыргызнефтегаз» ААК тарабынан «Петро Кыргызстан ЛТД» ЖЧКсына тиешелүү 50% акцияны сатып алуу боюнча бардык керектүү документтер бүткөрүлдү. Ошентип, «Кыргызнефтегаз» ААК «Кыргыз Петролеум Компани» ЖАКтын жалгыз акционери болуп калды. «Кыргыз Петролеум Компани» ЖАКты сатып алгандан кийин «Кыргызнефтегаз» ААК мунай чалгындоо жана өндүрүүдөн баштап мунай продуктуларын өндүрүү жана сатууга чейинки толук өндүрүш циклине ээ болгон жалгыз компания болуп калды. Кийин компанияда ишин токтоткон чет элдик адистердин ордун билим жөндөмү жетиштүү жергиликтүү адистер ээледи. 2012-жылдын март айында ишкананын кызматкерлери тарабынан 2016-жылы Кыргыз Республикасынын юстиция органдарында каттоодон өткөн «Баштапкы профсоюз уюму» түзүлүп, учурда өз алдынча коомдук профсоюз уюмуна айланган жана «Башталгыч профсоюз уюму» ассоциациясынын мүчөсү болуп саналат, «КНГ» ААКнын профсоюздары.

Өндүрүштү модернизациялоо боюнча иш-чаралар жүргүзүлүүдө. Компаниянын алдында чоң милдеттер жана ишкананы өнүктүрүү боюнча чаралардын ар тараптуу комплекси турат. “КПК” ЖАК заманбап талаптарды жана мунай иштетүү тармагындагы өзгөрүүлөрдү, сапатты жогорулатууну жана өнөктөштөр менен тыгыз кызматташууну эске алуу менен натыйжалуу өндүрүшкө жана ишкананын динамикалык өнүгүүсүнө багытталган бардык күч-аракетин мындан ары да жумшай бермекчи.